工程合同三年了款没付完有效吗

工程合同三年未付清款仍有效，但结算需按法律规定。依据《合同法》，合同无效则自始不存在，不能按约定结算。若合同无效仍不处理，可能导致承包人权益受损，无法获得应有补偿。
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处理此类问题，常见方式有协商、诉讼或仲裁。应先尝试友好协商，若协商无果，可根据合同约定选择诉讼或仲裁，以确保权益得到保障。
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合同三年未付清款，应这样处理：1. 首先与对方协商，明确欠款原因及还款计划；2. 若协商无果，可准备合同及相关证据，提起诉讼或仲裁；3. 在诉讼或仲裁过程中，根据《合同法》等规定，主张合法权益，要求对方支付欠款及可能产生的利息等。